Por defecto, al instalar Ubuntu 12.04 aparecen los botones a la izquierda. Si deseas cambiar los botones a la derecha, sigue estos pasos:

1. Instala gconf-editor con:

sudo apt-get install gconf-editor

2. Iniciar gconf-editor con: gconf-editor
3. Buscar la ruta: apps/metacity/general
4. Modificar el contenido de close,minimize,maximize: a :minimize,maximize,close